Découverte et validation des biomarqueurs pour guider la prise en charge clinique de la pneumonie chez les enfants africains

Lipocalin distingue la pneumonie sévère et bactérienne de la pneumonie non évolutive et non bactérienne avec un haut niveau de précision L’impact clinique de ce biomarqueur nécessite une évaluation clinique à grande échelle

Les algorithmes cliniques restent sous-optimaux pour distinguer la pneumonie sévère des autres causes de détresse respiratoire telles que le paludisme ou distinguer la pneumonie bactérienne et la pneumonie d’autres causes, telles que les virus Les outils moléculaires pourraient améliorer le diagnostic et la gestionMéthodes Nous avons mené une étude protéomique basée sur la spectrométrie de masse pour identifier et valider les marqueurs de sévérité chez les enfants gambiens atteints de pneumonie n = et les témoins appariés selon l’âge, le sexe et le quartier n = Validation indépendante réalisée chez des enfants kenyans présentant une détresse respiratoire avec pneumonie, avec Plasmodium paludisme à falciparum, et avec les deux valeur prédictive a été estimée par l’aire sous la courbe caractéristique du récepteur AUCResults Lipocalin Lpc- était le meilleur biomarqueur de la protéine de la pneumonie sévère AUC, [% intervalle de confiance, -] et hautement prédictive de bactériémie% [% -% ], bactériémie pneumococcique% [% -%], un Ces résultats ont été validés chez des enfants kényens atteints de paludisme grave et de détresse respiratoire qui répondaient également à la définition de la pneumonie établie par l’Organisation mondiale de la santé. La combinaison de Lpc et d’haptoglobine distinguait l’origine bactérienne du paludisme et la détresse respiratoire. avec une sensibilité et une spécificité élevées chez les enfants gambiens AUC,% [% intervalle de confiance,% -%] et enfants kenyans% [% -%] Conclusions Lpc- et l’haptoglobine peuvent aider à discriminer l’étiologie de la pneumonie cliniquement définie et pourraient être utilisés pour améliorer clinique gestion Ces biomarqueurs devraient être évalués plus avant dans des études cliniques prospectives

pneumonie, paludisme, lipocaline / NGAL, infection respiratoire, biomarqueursLa pneumonie est la principale cause de décès chez les jeunes enfants dans le monde, causant près de millions de décès chaque année, principalement dans les pays en développement En Gambie, infection aiguë des voies respiratoires inférieures Pour atteindre et dépasser l’Objectif du Millénaire pour le développement des Nations Unies en matière de survie de l’enfant, il faut réduire le nombre de décès dus à la pneumonie. Cela nécessitera une combinaison de mesures préventives efficaces et de Amélioration de la prise en charge clinique Des études antérieures ont montré que la référence différée est l’un des principaux facteurs de risque de décès chez les enfants atteints de pneumonie . Par conséquent, le sur-renvoi des cas de pneumonie a été un problème important avec l’Organisation mondiale de la Santé. Il est important de noter que les critères cliniques ne distinguent pas les causes bactériennes de la pneumonie d’autres causes telles que les virus ne nécessitant pas de traitement antibiotique. L’analyse des biofluides, par exemple le plasma utilisant des méthodes basées sur la spectrométrie de masse, a été largement adoptée. découverte de biomarqueurs Une fois identifiées et validées, les protéines de valeur clinique pourraient être incorporées dans des tests rapides sur le lieu de soins. Chez les enfants africains, la pneumonie n’est pas la seule cause de détresse respiratoire chez les enfants Dans les zones endémiques, l’infection à Plasmodium falciparum la détresse respiratoire et le chevauchement de ces états compromettent souvent le diagnostic et la prise en charge de ces patients Dans les admissions pédiatriques aiguës, le syndrome clinique de pneumonie sévère se chevauchait en% de cas sévères de paludisme Nous avons réalisé une étude pour décrire la signature protéomique plasmatique dans des échantillons d’enfants gambiens atteints de pneumonie grave et une pneumonie non Nous avons identifié et validé des biomarqueurs pour prédire la sévérité de la maladie chez les enfants atteints de pneumonie, prédire l’hémoculture, prédire l’étiologie bactérienne probable des enfants atteints de pneumonie, évaluer la performance des biomarqueurs pour discriminer la détresse respiratoire causée par la pneumonie ou le paludisme grave. pour la performance diagnostique de ces marqueurs chez les enfants kenyans

Méthodes

Sites d’étude et populations étudiées

Les participants à l ‘étude étaient des nourrissons et des enfants des régions du Grand Banjul et Basse participant à une étude cas – témoins de pneumonie infantile et d’ enfants hospitalisés à l ‘hôpital du district de Kilifi avec un diagnostic d’ infection des voies respiratoires inférieures. , et les définitions cliniques sont décrites en détail dans les Méthodes Supplémentaires et Supplémentaires DataTable Caractéristiques Démographiques et Cliniques des participants à l’étude par groupe de résultats Caractéristique Pneumonie Contrôle de la sévérité n = non sévère n = sévère n = très sévère n = P Valuea âge, médiane IQR, mo – – – – Sexe masculin,% score z poids-pour-âge,% IC moyen – – à – – – à – – – à – – – à – & lt; Taux respiratoire, SD moyen, respirations / min & lt; Saturation en oxygène, moyenne SD,% & lt; Culture bactérienne positive, Non% … Contrôle de sévérité de pneumonie caractéristique n = non sévère n = sévère n = très sévère n = P Valuea âge, médiane IQR, mo – – – – sexe masculin,% poids z pour l’âge, CI moyen% – – à – – – à – – – à – – – à – & lt; Taux respiratoire, SD moyen, respirations / min & lt; Saturation en oxygène, moyenne SD,% & lt; Culture bactérienne positive, No% … Abréviations: IC, intervalle de confiance; IQR, intervalle interquartile; Les valeurs SD, écart-type standard ont été obtenues en utilisant Kruskal-Wallis ou χ test pour les variables quantitatives ou discrètes, respectivement

Etudes de découverte et de validation de biomarqueurs

Des échantillons de plasma de nourrissons gambiens et d’enfants âgés de – mois ont été utilisés pour des études protéomiques basées sur la spectrométrie de masse voir les méthodes supplémentaires pour les détails Les concentrations de protéines C-réactive sélectionnées [CRP], facteur von Willebrand [vWF], lipocaline [Lp-] l’haptoglobine ont été mesurées avec un système de dosage immuno-enzymatique R & D, selon les instructions du fabricant

Gestion des données et analyses statistiques

Les données cliniques ont été recueillies sur des formes standardisées et des modèles de régression logistique multiples ont été ajustés pour toutes les variables cliniques en utilisant la gravité de la maladie et l’étiologie bactérienne probable comme variable dépendante. L’interaction des variables indépendantes a été vérifiée en utilisant le test du ratio de vraisemblance. StataCorp

Performance diagnostique et sélection des variables cliniques pour les modèles multivariés

L’aire sous la courbe caractéristique de fonctionnement du récepteur AUC a été utilisée pour comparer la sensibilité et la spécificité des marqueurs sélectionnés. Les valeurs de coupure ont été choisies en fonction de la sensibilité et de la spécificité les plus élevées pour prédire le résultat à l’aide de la fonction roctab / detail. variable, les estimations ont été dérivées d’un modèle de régression logistique utilisant les marqueurs sélectionnés ou des caractéristiques cliniques comme variables indépendantes et la condition à diagnostiquer comme variable dépendante. Ces analyses ont été effectuées en utilisant les fonctions lroc, lstat et roctab / graph dans Stata. et des rapports de vraisemblance négatifs ont été calculés pour les concentrations de biomarqueurs ayant la plus grande sensibilité et spécificité pour prédire une pneumonie sévère. Des variables cliniques et / ou des marqueurs moléculaires ont été inclus dans les modèles multivariés si la variable présentait une association statistiquement significative P & lt; dans le modèle univarié et la variable n’a pas été utilisée comme critère de classification a priori Par exemple, la fréquence respiratoire a été combinée avec des marqueurs moléculaires pour comparer la pneumonie non sévère et sévère car cette variable n’a pas été utilisée comme critère pour séparer les conditions logiques univariées ordinales modèles de régression utilisant la sévérité de la maladie codée comme – de contrôle à très sévère car la variable dépendante a été utilisée pour évaluer l’importance de l’association entre la concentration de biomarqueurs et les résultats cliniques

Approbation éthique

Le comité d’éthique du MRC a approuvé le comité d’éthique pour l’étude sur la pneumonie SCC / EC et l’étude sur le paludisme grave SCC / EC et l’utilisation des échantillons de plasma archivés. du Kenya a été approuvé par l’Institut de recherche médicale du Kenya KEMRI Ethics Review Committee SSC

RÉSULTATS

Performance Diagnostique Des Caractéristiques Cliniques Et Des Biomarqueurs De Protéines Pour Discriminer La Pneumonie Sévère Et La Pneumonie Non-Publique

L’analyse protéomique a identifié des protéines chez les enfants atteints de pneumonie sévère, chez les enfants atteints de pneumonie non évolutive et chez les témoins sains La différence de nombre de protéines entre différents groupes et lots n’était pas significativement différente, P = Nous avons identifié les protéines différentiellement régulées & gt; Données supplémentaires Parmi ces protéines, seulement% indiquaient un schéma de progression, à savoir une augmentation de la concentration des témoins dans les cas bénins à sévères. Tableau de concentrations moléculaires des marqueurs par groupe de marqueurs Moléculaire Marqueur Pneumonie Contrôle de la sévérité Faible Très sévère P Valuea Concentration médiane IQR [Non] Nombre de peptides utilisés pour identifier ces protéines et leur pertinence biologique, Lpc-, CRP et vWF ont été sélectionnés pour validation. Lpc-, ng / mL – – – – & lt; Haptoglobine, mg / mL – – – – & lt; vWF, mU / mLb – – – – & lt; CRP, μg / mLb – – – – & lt; Moléculaire Marqueur Pneumonie Contrôle de la sévérité Légère Sévère Très Sévère P Valuea Concentration médiane IQR [Non] Lpc-, ng / mL – – – – & lt; Haptoglobine, mg / mL – – – – & lt; vWF, mU / mLb – – – – & lt; CRP, μg / mLb – – – – & lt; Abréviations: CRP, protéine C-réactive; IQR, intervalle interquartile; Lpc-, lipocaline; vWF, von Willebrand Les valeurs de factoraP sont dérivées d’un modèle de régression logistique univariée ordinale où la variable dépendante de la gravité de la maladie est codée – de contrôle à très sévère et les variables indépendantes sont les concentrations des biomarqueurs. Le volume d’échantillon disponible pour les mesures immuno-enzymatiques était limité, et la Lpc- et l’haptoglobine étaient prioritaires par rapport au vWF ou à la CRP. Ceci explique les écarts observés dans le nombre d’échantillons testés pour la CRP et le vWF

Les taux de Lpc, de CRP et de vWF étaient significativement plus élevés chez les enfants atteints de pneumonie grave que chez ceux présentant une pneumonie non évolutive. Données supplémentaires Lpc- était le meilleur prédicteur de pneumonie grave, avec une sensibilité de% et une spécificité de% AUC, [CI], -]; Table chez les enfants avec niveaux Lpc & gt; ng / mL, les probabilités d’avoir une maladie grave ont augmenté de près de l’odds ratio [OR], [% CI, – Une concentration de CRP & gt; μg / mL était associé à une augmentation de la sévérité de la maladie OU, [% CI, -], mais malgré sa bonne sensibilité pour prédire la gravité de la maladie%, sa spécificité était faible% De même, les concentrations plasmatiques en vWF & gt; mU / mL ont été associés à une augmentation de la probabilité de pneumonie grave OR, [% CI, -], avec une bonne sensibilité% mais une faible spécificité%; Figure Tableau Performances diagnostiques des caractéristiques cliniques et des marqueurs moléculaires associés à un risque de pneumonie sévère ou très grave par rapport à la pneumonie non sévère Probabilité Ratioa Caractéristique clinique Enfants, Non AUC% CI Positif Négatif Taux respiratoireb – … … Cracklesb – … … Fréquence cardiaque – … … Pâleur – … … Marqueur moléculaire Lpc-b – CRPb – vWFb – Ratio de vraisemblance Caractéristique clinique Enfants, Non AUC% CI Positif Négatif Taux respiratoireb – … … Cracklesb – … … Fréquence cardiaque – … … Pallor – … … Marqueur moléculaire Lpc-b – CRPb – vWFb – Abréviations: AUC, aire sous la courbe de fonctionnement du récepteur; CI, intervalle de confiance; CRP, protéine C-réactive; Lpc-, lipocaline; vWF, von Willebrand factora Les rapports de vraisemblance positifs et négatifs ont été calculés pour les concentrations de biomarqueurs ayant la sensibilité et la spécificité les plus élevées pour prédire la pneumonie sévère Lpc-, ng / mL; CRP, mg / ml; et vWF, mU / mLb Variables indépendamment associées au résultat dans les modèles multivariésFigure View largeTélécharger la lameDiagnostic des marqueurs cliniques et moléculaires pour prédire la pneumonie sévère par rapport à la pneumonie non évolutive chez les enfants gambiens Seules les caractéristiques cliniques non utilisées pour distinguer les groupes ont été introduites dans le modèle voir Méthodes Les rapports de cotes avec des intervalles de confiance en pourcentage (IC) indiquent les probabilités de pneumonie sévère pour les valeurs seuils avec la sensibilité et la spécificité les plus élevées ici. Abréviations: CRP, protéine C-réactive; Lpc-, lipocaline; NPV, valeur prédictive négative; PPV, valeur prédictive positiveFigure DiagnostiqueDiagnostic des marqueurs cliniques et moléculaires pour prédire la pneumonie sévère vs la pneumonie non évolutive chez les enfants gambiens Seules les caractéristiques cliniques qui n’ont pas été utilisées pour distinguer les groupes ont été introduites dans le modèle voir Méthodes Rapports de cotes avec% d’intervalles de confiance. ] indiquent les probabilités de pneumonie sévère pour les valeurs limites avec la sensibilité et la spécificité les plus élevées. Abréviations: CRP, protéine C-réactive; Lpc-, lipocaline; NPV, valeur prédictive négative; VPP, valeur prédictive positive

La meilleure combinaison de marqueurs cliniques et moléculaires pour prédire la pneumonie sévère inclus fréquence respiratoire, craquements, Lpc-, et CRP L’addition de marqueurs moléculaires aux caractéristiques cliniques n’a eu aucun impact sur la sensibilité, mais a augmenté la spécificité de% à% Figure, et l’effet était données complémentaires La sensibilité de cette combinaison de marqueurs a augmenté à%% IC,% -% chez les enfants inscrits pendant la saison sèche, probablement en raison de l’absence de cas de paludisme. Données Seuls les enfants de% identifiés comme ayant une pneumonie avaient une glissade de paludisme positive Ces enfants avaient tous une pneumonie non grave inscrite pendant la saison sèche et pendant la saison des pluies

Association de Lpc- avec une pneumonie bactérienne probable

Des cultures bactériennes ont été pratiquées sur des patients atteints de pneumonie% De ceux-ci, de% étaient positifs pour les vrais pathogènes, à savoir Streptococcus pneumoniae n =, Staphylococcus aureus n =, et Streptococcus pyogenes n = Le taux de contamination était% Aucune des variables cliniques étaient associées des données supplémentaires positives de culture de sang, mais les enfants avec une concentration de Lpc- & gt; ng / mL a multiplié les chances d’avoir une hémoculture positive avec un isolat cliniquement significatif OR, [% IC, -]; Données supplémentaires Les concentrations plasmatiques de Lpc-, CRP et vWF chez les enfants avec une hémoculture positive ou avec une consolidation «point final» sur leur radiographie thoracique probable pneumonie bactérienne étaient significativement plus élevés que chez les enfants sans consolidation et un faible nombre de globules blancs P & lt; ; Tableau Les concentrations de Lpc- étaient fortement associées à une pneumonie d’origine bactérienne probable. La performance diagnostique de Lpc- était supérieure à celle de vWF ou CRP Lpc- présentaient une bonne sensibilité% [% IC,% -%] et une très haute spécificité% [% CI ,% -%] pour identifier les enfants atteints d’une pneumonie bactérienne probable Des résultats similaires ont été obtenus lorsque les patients ayant une hémoculture positive ont été exclus de l’analyse OU, [% CI, -] Tableau Population Description des patients atteints de pneumonie d’étiologie bactérienne probable ou probable Pneumonie Probable Non-bactérien n = Probable Bactérien n = P Valuea Âge, SD moyen, mo Sexe masculin,%%% Poids-pour-âge z score, SD moyen – – Taux respiratoire, SD moyen, respirations / min Oxygène saturation, moyenne SD,% & lt; Nombre de globules blancs, moyenne SD, × / L & lt; Hémoglobine, moyenne SD, g / dL & lt; Concentration du marqueur moléculaire, médiane IQR [No] Lpc-, ng / mL – – & lt; CRP, μg / mL – – & lt; vWF, mU / mL – – & lt; Caractéristique Pneumonie Probable Non-bactérien n = Probable Bactérien n = P Valuea Âge, moyenne SD, mo Sexe masculin,%%% Poids-pour-âge z score, SD moyen – – Fréquence respiratoire, SD moyen, respirations / min Oxygène saturation, SD moyen,% & lt; Nombre de globules blancs, moyenne SD, × / L & lt; Hémoglobine, moyenne SD, g / dL & lt; Concentration du marqueur moléculaire, médiane IQR [No] Lpc-, ng / mL – – & lt; CRP, μg / mL – – & lt; vWF, mU / mL – – & lt; Abréviations: CRP, protéine C-réactive; IQR, intervalle interquartile; Lpc-, lipocaline; SD, écart-type; vWF, facteur von Willebrand; WBC, les valeurs de cellaP de sang blanc ont été obtenues en utilisant Mann-Whitney ou test for pour variables quantitatives ou discrètes, respectivement. Vue de la performance de lipocaline Lpc-, von Willebrand facteur vWF et C-réactive protéine CRP dans la prédiction d’une infection bactérienne probable Abréviations: AUC, zone sous la courbe caractéristique de fonctionnement du récepteur; CI, intervalle de confiance; LR, rapport de vraisemblance; NPV, valeur prédictive négative; PPV, valeur prédictive positive; ROC, recevant la caractéristique de fonctionnementFigure View largeTélécharger la diapositive Performance diagnostique de la lipocaline Lpc-, le facteur von Willebrand vWF et la protéine C-réactive CRP dans la prédiction d’une infection bactérienne probable Abréviations: AUC, aire sous la courbe caractéristique de fonctionnement du récepteur; CI, intervalle de confiance; LR, rapport de vraisemblance; NPV, valeur prédictive négative; PPV, valeur prédictive positive; ROC, réception de la caractéristique de fonctionnement

L’haptoglobine dans la discrimination entre la pneumonie et la détresse respiratoire associée au paludisme chez les enfants gambiens

Figure A Nous avons pensé qu’un marqueur d’hémolyse comme l’haptoglobine pouvait discriminer la détresse respiratoire causée par une pneumonie de celle provoquée par un paludisme grave parce que les taux d’haptoglobine augmentent La sévérité médiane de l’intervalle interquartile plasmatique de l’haptoglobine chez les enfants atteints de paludisme grave et de détresse respiratoire ng / mL était inférieure d’un ordre de grandeur à celle des enfants atteints de pneumonie grave ng / mL [P & lt; ] Données supplémentaires La sensibilité et la spécificité de l’haptoglobine & gt; Les enfants présentant une pneumonie bactérienne probable ont présenté les plus fortes concentrations d’haptoglobine et de Lpc- données supplémentaires. Comparaison entre la pneumonie et le paludisme grave avec détresse respiratoire Figure C et D Seulement des patients% présentant la mutation de l’hémoglobine S de la génotype SS de la chaîne β-globine Les concentrations d’haptoglobine ne différaient pas significativement entre génotype AS ou SS et phénotypes AA Figure Vue largeDownload slideDiscrimination entre la pneumonie et la détresse respiratoire associée au paludisme chez les enfants gambiens A, Concentration plasmatique de lipocaline Lpc- chez les enfants présentant différents syndromes de détresse respiratoire et témoins La zone grisée indique la sous-analyse des cas de pneumonie bactérienne probable ou non bactérienne B, Distr ibution des cas de détresse respiratoire basée sur les niveaux plasmatiques de Lpc- et d’haptoglobine C, Diagnostic performance recevant la courbe caractéristique fonctionnelle de l’haptoglobine dans la discrimination entre la détresse respiratoire causée par la pneumonie et le paludisme grave avec détresse respiratoire D, Validation des performances diagnostiques dans une population indépendante de Enfants kenyans * P & lt; ; Abréviations: NS, non significatif; NSP, pneumonie non évolutive; RD, détresse respiratoire; SM, paludisme grave; A, Concentration plasmatique de lipocaline Lpc- chez les enfants présentant différents syndromes de détresse respiratoire et témoins La zone grisée indique la sous-analyse de cas définis comme bactériens probables ou probables non bactériens. Pneumonie B, Répartition des cas de détresse respiratoire basée sur les taux plasmatiques de Lpc- et d’haptoglobine C, Diagnostic performance recevant la courbe caractéristique opératoire de l’haptoglobine pour discriminer la détresse respiratoire causée par la pneumonie et le paludisme grave avec détresse respiratoire D, Validation des performances diagnostiques dans un population indépendante d’enfants kenyans * P & lt; ; Abréviations: NS, non significatif; NSP, pneumonie non évolutive; RD, détresse respiratoire; SM, paludisme grave; SP, pneumonie sévère

Lpc- et l’haptoglobine dans la discrimination entre la pneumonie et la détresse respiratoire associée au paludisme chez les enfants kenyans

Les performances diagnostiques de Lpc- et de l’haptoglobine dans la détresse respiratoire discriminante causée par la pneumonie ou le paludisme ont été évaluées dans une population indépendante d’enfants kenyans. Tableau Les mêmes valeurs seuils dérivées de l’ensemble de données gambien ont été appliquées. concentration plasmatique d’haptoglobine & gt; mg / ml, la détresse respiratoire était plus susceptible d’être causée par une pneumonie que par le paludisme OU, [% IC, -] La performance diagnostique basée sur la sensibilité et la spécificité était élevée mais attendue inférieure à celle observée chez les enfants gambiens. ,] La proportion d’enfants avec un paludisme sévère et une forte concentration d’haptoglobine de [%] était la différence majeure observée entre l’étude kenyane et gambienne. Nous avons observé une distribution bimodale en concentrations d’haptoglobine supérieure et inférieure à × ng / mL chez les enfants Tableau de données supplémentaires Description de la population des patients kényens souffrant de détresse respiratoire causée par le paludisme, la pneumonie ou les deux types de paludisme caractéristique n = Pneumonie n = Pneumonie et paludisme n = P Âge de Valuea, IQR médian, mo – – – Sexe masculin,% score z pondéral pour l’âge, SD moyen – – – Fréquence respiratoire, IQR médian, respirations / min – – La saturation en oxygène, moyenne SD,% – – – & lt; Numération leucocytaire, IQR médian, × / L – – – hémoglobine, moyenne SD, g / dL – – – & lt; Culture bactérienne positive, No% b & lt; Lpc-, IQR médian, ng / mL – – – Haptoglobine, IQR médian, ng / mL – – – & lt; Caractéristique Paludisme n = Pneumonie n = Pneumonie et paludisme n = P Valuea Âge, IQR médian, mo – – – Sexe masculin,% Poids-pour-âge z score, SD moyen – – – Taux respiratoire, IQR médian, respirations / min – – Saturation en oxygène, moyenne SD,% – – – & lt; Numération leucocytaire, IQR médian, × / L – – – hémoglobine, moyenne SD, g / dL – – – & lt; Culture bactérienne positive, No% b & lt; Lpc-, IQR médian, ng / mL – – – Haptoglobine, IQR médian, ng / mL – – – & lt; Abréviations: IQR, intervalle interquartile; Lpc-, lipocaline; SD, écart-type; WBC, valeurs de cellaP du sang blanc ont été obtenues en utilisant Kruskal-Wallis ou χ pour des variables quantitatives ou discrètes, respectivementb La culture bactérienne positive comprend les microorganismes significatifs suivants: échantillons de Streptococcus pneumoniae, échantillons de Salmonella spp, et Staphylococcus aureus, Escherichia coli, et streptocoque β-hémolytique Les chances d’une culture bactérienne positive avec un isolat bactérien significatif étaient significativement plus élevées chez les enfants avec des concentrations plasmatiques plus élevées de Lpc-OR, [% CI, -] Cependant, la performance diagnostique de Lpc- dans la prédiction de bactériémie était plus faible que chez les enfants gambiens ASC, [% CI, -] Chez les enfants kenyans, l’état nutritionnel, mesuré avec le score z taille-âge et le poids pour l’âge, était inversement corrélé avec la concentration Lpc r = – [P =] et r = – [P =] Ces différences n’ont pas été observées chez les enfants gambiens Nous avons donc raisonné que les différences dans la proportion d’enfants malnutris dans les populations kenyane et gambienne En effet, la proportion d’enfants présentant un retard de croissance mesuré avec le score z de la taille par rapport à l’âge était plus élevée chez les enfants kenyans que chez les enfants gambiens. Le score z de la taille par rapport à l’âge les mesures de l’état nutritionnel et la présence de candidose buccale étaient indépendamment associées à la bactériémie. La performance diagnostique de Lpc- dans la prédiction de l’infection sanguine augmentait jusqu’à une AUC de% IC,% -% après ajustement pour ces variables Données supplémentaires Le virus de l’immunodéficience humaine VIH le statut était disponible pour les patients% et était positif chez les patients% des patients avec candidose buccale, étaient séronégatifs% VIH n’était pas associé à une infection du flux sanguin dans la population étudiée OR, [% CI, -] La performance diagnostique de Lpc- in prédire bactériémie était plus élevé chez les jeunes enfants âgés de & lt; mois après l’ajustement pour ASC de retard de croissance,%, alors que l’haptoglobine a mieux performé chez les enfants plus âgés & gt; mois indépendamment de l’état nutritionnel

DISCUSSION

L’hypothèse de départ de notre étude était que l’ajout de marqueurs moléculaires pourrait augmenter la spécificité de la définition clinique de la pneumonie sévère. Dans ce contexte, nous avons signalé des biomarqueurs plasmatiques potentiels seuls ou en association avec des caractéristiques cliniques. Les résultats indiquent que la CRP et Lpc- peuvent distinguer correctement la plupart des patients avec une pneumonie sévère de ceux avec une pneumonie non évolutive et une probable bactérienne à partir de causes probables non bactériennes. La sensibilité de ces marqueurs l’analyse a été réalisée exclusivement chez les enfants atteints de pneumonie recrutée pendant la saison sèche. La spécificité de ce panel de marqueurs a diminué de% à% lorsque l’analyse a été réalisée chez les enfants inscrits pendant la saison des pluies. et le fait que Il a été démontré que la CRP et la Lpc- augmentent chez les enfants atteints de paludisme , il est plausible que cette augmentation de sensibilité et de spécificité s’explique par le faible nombre d’infections palustres durant la saison sèche. réduire, mais pas complètement, le nombre de cas de faux-positifs qui accablent les services de santé occupés. De même, notre panel de biomarqueurs s’est bien comporté contre la définition plus récente de sévérité proposée par l’OMS dans Supplementary Data. Nous rapportons que Lpc- est associé à la est particulièrement important parce que les caractéristiques cliniques n’identifient pas les enfants ayant une hémoculture bactérienne positive. Nous n’avons pas confirmé les résultats de certaines études antérieures signalant une association entre une infection bactérienne et les signes cliniques de détresse respiratoire ou de température élevée. nous sommes également les premiers à signaler que Lpc- est associée à une pneumonie de prob origine bactérienne, définie par la présence d’une consolidation sur la radiographie thoracique ou une hémoculture positive Ceci était vrai pour les définitions de pneumonie bactérienne primaire et non bactérienne L’association de Lpc- avec des hémocultures positives et une pneumonie d’origine bactérienne probable est biologiquement plausible et cliniquement Nous avons également observé que l’association Lpc- et bactériémie chez les enfants kenyans, bien que significative, était partiellement compromise par l’état nutritionnel du patient. Cette observation peut s’expliquer, au moins en partie, par la capacité réduite des patients souffrant de malnutrition chronique à générer réponse immunitaire efficace à l’infection Cette limitation peut être importante dans la conception des études prospectives, et différentes valeurs de coupure peuvent être requises pour les populations présentant un retard de croissance sévère. Le rôle de Lpc- dans la défense innée contre l’infection bactérienne est bien établi La transcription du gène Lpc- été montré à la hausse dans les macropha activés Plus important encore, la transcription Lpc- est augmentée par le repliement de la muqueuse nasale des souris en réponse à la colonisation par S pneumoniae et par Haemophilus influenzae Dans les pays à ressources limitées lorsque les laboratoires et la radiologie sont rarement disponibles pour aider à diagnostiquer les cas de pneumonie bactérienne, des marqueurs moléculaires tels que Lpc- pourraient être développés en un outil de diagnostic au point de service pour cibler les cas nécessitant un traitement antibiotique. traitement antibiotique chez les patients présentant une reprise clinique rapide De même, pour les infections respiratoires aiguës au niveau communautaire, Lpc- pourrait être utilisé pour déterminer les indications et guider le moment du traitement antibiotique Le flux protéomique utilisé dans cette étude ne pouvait pas identifier les protéines à des concentrations inférieures à la plage du milieu nanogramme par millilitre , comme le facteur de nécrose tumorale, l’interleukine et l’alcitonine, précédemment associée à une infection du sang Nous avons trouvé que l’haptoglobine en association avec Lpc- était remarquablement efficace pour distinguer la pneumonie du paludisme chez les enfants souffrant de détresse respiratoire. Deux raisons majeures expliquent cette observation. Premièrement, l’hémolyse est une caractéristique majeure Au cours de l’hémolyse active, l’hémoglobine libre se lie à l’haptoglobine, entraînant un épuisement rapide de cette molécule du plasma Deuxièmement, la concentration d’haptoglobine plasmatique augmente avec la gravité de la maladie chez les patients atteints de pneumonie les diagnostics peuvent aider à prendre des décisions cliniques rapides dans les pays en développement Des études d’efficacité clinique et d’analyse coût-efficacité sont nécessaires pour estimer l’impact potentiel de ces nouveaux outils Dans les zones endémiques, l’association Lpc- avec l’haptoglobine doit être évaluée prospectivement. utiliser pour guider la prise en charge clinique des enfants atteints de maladies respiratoires tress

Remarques

Remerciements Nous tenons à remercier l’unité de la CRM et le personnel de terrain, les infirmières, le personnel de laboratoire, le personnel chargé des données, les chauffeurs et le personnel administratif du projet d’études sur la pneumonie sévère et la surveillance pneumococcique en Gambie. le personnel de l’hôpital MRC de Fajara; le personnel de santé du gouvernement à l’Hôpital Royal Victoria et les centres de santé de Basse, Fajikunda, Serekunda et Brikama. Merci à Simon Donkor pour le travail de gestion des données, Nuru Adams pour la gestion des échantillons de plasma, et Roman Fischer et Nicola Ternette pour leur engagement et leur aide dans les analyses de spectrométrie de masse. Nous aimerions remercier les infirmières et les agents de terrain de l’Hôpital universitaire Royal Victoria, Yaya Dibba, Anthony Mendy et Abdoulie Camara; techniciens de laboratoire principaux, Janet Riddle-Fullah, Abdou Bah; Le commis à la saisie des données Jalimory Njie, le clinicien Emmanuel Onykwelu, le clinicien Augustine Ebonyi et Haddy Njie; Les techniciens de laboratoire du CRM et les assistants Idrissa Sambou, Simon Correa, Madi Njie et Omar Janha; Le superviseur des données de Haddy Kanyi et l’administrateur du programme de lutte contre le paludisme de Mamkumba Sanneh MRC; les participants à l’étude et leurs parents / tuteurs; Kim Mulholland et Brian Greenwood pour encouragement et conseil. Merci aussi au personnel clinique et infirmier du programme de recherche KEMRI / Wellcome Trust sur les services pédiatriques et aux équipes d’étude RESPIRE et d’étiologie de la pneumonie, en particulier Anthony Scott, James Nokes et Neema Mturi. , Mwanajuma Ngama, et Sidi Kazungu pour leur aide Cet article a été publié avec la permission du directeur du KEMRIFinancement financier Ce travail a été soutenu par la subvention G du Conseil de recherches médicales du Royaume-Uni, les subventions du Wellcome Trust / Z // Z, / Z / Z , et / Z / et le Bill & amp; Melinda Gates Foundation, à travers la Fondation pour les Instituts nationaux de la santé dans le cadre de l’initiative Grands Défis dans la santé mondiale HH, RI, MLT, MJ, BE, OC, CO, GM, DK et SH sont soutenus par le Conseil de recherches médicales UK EG, HK, et JB sont soutenus par le Wellcome Trust DK est soutenu par la MRC, Wellcome Trust, et la Fondation Bill et Melinda Gates CCP est soutenu par le MRC UK Clinician Scientist Fellowship GPotential conflits d’intérêts Tous les auteurs: Aucun conflit signaléTous Les auteurs ont soumis le formulaire ICMJE pour la divulgation des conflits d’intérêts potentiels Conflits que les éditeurs jugent pertinents pour le contenu du manuscrit ont été divulgués