Le fardeau mondial de la gastro-entérite salmonellose non typhoïde

Pour estimer le fardeau global de la gastro-entérite à Salmonella non nyphoïde, nous avons synthétisé les données existantes issues de la surveillance en laboratoire et d’études spéciales, avec une préférence hiérarchique pour les études prospectives basées sur la population, dquo; Nous avons appliqué des estimations d’incidence aux projections démographiques pour les régions du fardeau mondial des maladies afin de calculer les nombres régionaux de cas, qui ont été additionnés pour fournir un nombre global de cas. Calculs d’incertitude ont été effectués en utilisant la simulation de Monte Carlo Des millions de cas de gastroentérite due aux salmonelles surviennent chaque année dans le monde, avec des décès allant du centenaire au décès, dont environ un million de cas étaient d’origine alimentaire. L’infection à Salmonella représente un fardeau considérable dans les deux cas. Pays en développement et pays développés Les efforts visant à réduire la transmission des salmonelles par les aliments et d’autres voies doivent être mis en œuvre à l’échelle mondiale

Les salmonelles sont une cause bactérienne majeure de gastro-entérite aiguë Bien que l’impact global des infections à Salmonella sur la santé humaine n’ait pas été estimé, la gastro-entérite est une cause majeure de morbidité et de mortalité dans le monde entier chez les enfants μ ans et dans la population générale Dans une étude de quatre pays développés, Scallan et al ont estimé que l’incidence des maladies diarrhéiques variait entre des épisodes par personne-année; Une estimation prudente du fardeau des maladies diarrhéiques causées par les salmonelles et d’autres agents pathogènes d’origine alimentaire est nécessaire pour fixer efficacement les objectifs de santé publique et allouer des ressources pour réduire le fardeau de la maladie. Récemment, l’OMS a établi le groupe de référence épidémiologique sur le fardeau des maladies d’origine alimentaire pour fournir des estimations mondiales des maladies d’origine alimentaire Bien que la surveillance en laboratoire fournisse des informations utiles sur les tendances, elle sous-estime la charge de morbidité. une personne malade doit consulter un médecin, soumettre un échantillon de selles, le laboratoire doit rechercher le pathogène et signaler un résultat positif, et l’infection confirmée en laboratoire doit être confirmée par les autorités de santé publique. Par conséquent, les cas de surveillance en laboratoire représentent une fraction de la communauté totale cas Plusieurs pays ont mené des études prospectives basées sur la population ou des enquêtes transversales pour déterminer l’ampleur du sous-dosage dans la surveillance en laboratoire [,, -] Cependant, les estimations globales sont difficiles à calculer car de nombreux pays, en particulier les pays en développement, Crump et al ont estimé le fardeau mondial de la fièvre typhoïde en résumant les données disponibles et en extrapolant aux pays et régions où les données étaient insuffisantes. L’OMS a recommandé une approche similaire pour estimer le fardeau mondial des maladies d’origine alimentaire. nous avons synthétisé les données existantes provenant de la littérature, des études spéciales et de la surveillance en laboratoire pour estimer le fardeau mondial de la gastro-entérite à Salmonella non-thyroïdienne.

Méthodes

Incidence régionale Nous avons classé la population mondiale en régions, comme l’indique l’étude sur la charge mondiale de morbidité, les blessures et les facteurs de risque GBD; Tableau Nous avons utilisé les estimations démographiques régionales de la variation de la fécondité médiane du Département des affaires économiques et sociales du Département des Nations Unies pour l’année , et inclus les populations régionales comme estimations ponctuelles, sans incertitude dans le modèle stochastique

Pour tenir compte du sous-dénombrement, les données de notification ont été multipliées par une estimation multiplicatrice spécifique de Salmonella obtenue de la littérature. Si les données de notification de la maladie n’étaient pas disponibles, nous avons utilisé une estimation de l’incidence de Salmonella dans un ou plusieurs pays. Étant donné que l’incidence chez les voyageurs étrangers ne représente que la fraction des voyageurs qui demandent des soins et soumettent des selles une fois de retour dans leur pays d’origine, nous avons ajusté la sous-estimation en utilisant une estimation de multiplicateur spécifique à Salmonella. la susceptibilité des voyageurs étrangers à l’infection est probablement plus grande que la sensibilité de la population résidente, potentiellement due à l’absence d’exposition préalable aux sérotypes régionaux ou à des risques d’exposition différents, nous avons créé un facteur de correction dquo; En comparant les estimations d’incidence des voyageurs de retour à ceux de la population résidente, par région, où les données sont autorisées dans les régions où aucune des sources de données ci-dessus n’était disponible, les données ont été extrapolées à partir de la région géographique la plus proche. Les estimations de l’incidence et du sous-dénombrement de Salmonella ont été identifiées dans la littérature scientifique publiée pour la période – en utilisant le mot-clé Salmonella et l’un des mots-clés suivants: dquo; incidence, dquo; dquo; prévalence, dquo; la santé publique, dquo; dquo; mortalité, dquo; dquo; surveillance de la population, dquo; dquo; surveillance, dquo; dquo; fardeau, dquo; dquo; distribution, dquo; dquo; aire, dquo; dquo; emplacement, dquo; les pays en développement, dquo; les pays développés, dquo; dquo; pays, dquo; d’épidémiologie, dquo; dquo; géographie, dquo; et permutations du mot dquo; monitor- dquo; Nous avons également consulté des membres de l’OMS Global Salm-Surv, un réseau international de laboratoires et de personnes impliquées dans la surveillance, l’isolement, l’identification et les tests de résistance aux antimicrobiens de Salmonella afin d’identifier études non publiées Incidence mondiale: Pour chaque région de GBD, la population estimée a été multipliée par l’incidence estimée de gastro-entérite à Salmonella Le nombre annuel de cas a été additionné dans toutes les régions pour donner le nombre annuel de cas de gastro-entérite à Salmonella dans le monde. Utilisation répétée de la simulation Monte Carlo pour tenir compte des incertitudes dans les incidences estimées Chaque estimation d’incidence a été modélisée comme une distribution PERT La distribution PERT est une courbe lisse, qui met l’accent sur des valeurs plus proches de la valeur la plus probable. données d’opinion L’estimation de l’incidence rapportée dans la littérature a été utilisée comme valeur la plus probable dans la distribution PERT correspondante. Pour la majorité des estimations d’incidence, les intervalles de confiance ont été rapportés dans la littérature et ont donc été utilisés comme valeurs minimales et maximales dans la distribution PERT. ; Étant donné que les données de notification de maladie ne comportaient pas d’intervalle de confiance, dans les régions où nous avons utilisé ces données, nous avons utilisé les incidences les plus faibles et les plus élevées de la région comme valeurs minimales et maximalesUne répartition des estimations du nombre annuel de cas de gastro-entérite due à Salmonella dans le monde a été générée dans @RISK, version Palisade Corporation, avec, itérations et échantillonnage Hypercube latin Pour déterminer le nombre annuel de décès, nous avons utilisé deux taux de létalité pour paramétrer une distribution uniforme:% et% Une analyse de sensibilité a été menée pour déterminer quels paramètres avaient le plus d’influence sur le nombre annuel estimé de cas, en classant les coefficients de corrélation entre chacun des paramètres d’entrée et nombre de cas Des scénarios ont été exécutés pour explorer l’impact du paramètre de modèle le plus influent, sélectionnez m Nous estimons que la proportion de cas estimés de gastro-entérite à Salmonella qui étaient d’origine alimentaire a été évaluée à partir de la moyenne des taux d’incidence des maladies d’origine alimentaire. La proportion de cas d’origine alimentaire a été multipliée par le nombre annuel de cas pour estimer le nombre annuel de cas de gastro-entérite d’origine alimentaire dus aux espèces de Salmonella En raison de l’incertitude associée à ces valeurs d’attribution de source, nous avons également calculé des estimations en utilisant les pourcentages les plus faibles et les plus élevés dans la littérature publiée

Résultats

Disponibilité des données; Nous avons trouvé, des articles avec le mot-clé Salmonella, qui, lorsque liés avec les mots-clés secondaires, réduites à, articles, dont étaient liés à des humains De ceux-ci nous avons identifié une étude prospective, populationnelle, de l’Angleterre dans le s , qui a estimé l’incidence de l’infection à Salmonella dans la communauté Cette incidence a été extrapolée à l’Europe, Western dquo; Les pays de la région de GBD ont eu des études de multiplication, dquo; qui a utilisé des incidences confirmées en laboratoire ajustées pour sous-détermination L’incidence estimée de Salmonella d’Australie a été extrapolée à l’Australasie dquo; région, Jordanie à la dquo; Afrique du Nord / Moyen-Orient dquo; région, Japon à l’Asie-Pacifique, revenu élevé dquo; région, et la Chine Ran Lu, branche de contrôle et de prévention des maladies infectieuses entériques, Centre chinois pour le contrôle et la prévention des maladies, des données non publiées à l’Asie; région L’incidence estimée des États-Unis et du Canada a été moyennée, et extrapolée à l’Amérique du Nord, Revenu élevé dquo; Les données de l’Autorité européenne de sécurité des aliments ont été utilisées, à l’exception de la Slovénie, pour lesquelles les données ont été utilisées. Les données sur les notifications de maladies des pays dans les régions ont été moyennées, et multiplié par un multiplicateur spécifique de Salmonella en provenance des Pays-Bas , et l’estimation de l’incidence qui en résulte a été appliquée à l’Europe respective. et l’Europe, Eastern Dquo; RégionsLes sept régions du GBD disposaient d’informations sur l’incidence de la gastro-entérite à Salmonella chez les voyageurs suédois Ces incidences ont été multipliées par le multiplicateur spécifique aux salmonelles des Pays-Bas , puis par le facteur de correction pour tenir compte des différences de sensibilité et la population résidente dans une région donnée Le facteur de correction a été calculé en tirant parti du fait que les estimations d’incidence étaient disponibles pour la région d’Afrique du Nord / Moyen-Orient: une d’une étude multiplicatrice de Jordanie et une de La proportion de ces estimations a été utilisée pour corriger la susceptibilité accrue des Suédois en voyage par rapport aux résidents régionaux Pour les régions GBD finales, il a été nécessaire d’extrapoler à partir des régions voisines L’incidence calculée à partir de l’étude multiplicateur australienne a été extrapolé au dquo; Océanie dquo; région, et l’incidence calculée à partir de l’étude multiplicateur de Chine Ran Lu, Direction du contrôle et de la prévention des maladies infectieuses entériques, Centre chinois de contrôle et de prévention des maladies; Des données non publiées ont été extrapolées à l’Asie du Sud-Est; La répartition des estimations du nombre annuel de cas de gastro-entérite à Salmonella dans le monde est présentée dans la Figure 2. Dans l’ensemble, nous estimons que des cas de gastro-entérite due à des salmonelloses non thyphoïdiques surviennent chaque année. On estime le nombre de décès et l’incidence par personne, par région de GBD, sous-région de l’OMS et dans l’ensemble Tableau On estime que les causes de Salmonella non thyphoïdales, décès au centile,, -, décès chaque année, dans le monde entier. En ce qui concerne la proportion d’infections à Salmonella d’origine alimentaire, nous avons estimé que, parmi les cas, les cas sont d’origine alimentaire et que le nombre de cas d’origine alimentaire est probable entre, en supposant que% sont d’origine alimentaire et sont d’origine alimentaire

Figure Vue largeDownload slideDistribution de valeurs plausibles pour le nombre annuel estimé de cas de gastro-entérite à Salmonella dans le monde entier, circa, montrant les percentiles et les percentiles. Vue largeDownload slideDistribution de valeurs plausibles pour le nombre annuel estimé de cas de gastroentérite à Salmonella dans le monde entier. percentiles Le paramètre d’entrée ayant le plus d’influence sur le nombre annuel estimé de cas était l’estimation de l’incidence pour l’Asie. Pour illustrer son impact, nous avons exécuté les scénarios: avec une incidence décroissante, avec une incidence décroissante, et en utilisant des données provenant d’autres sources considérées comme inférieures dans la hiérarchie, renvoyant les données des voyageurs et l’extrapolation du Japon. notre hypothèse que les voyageurs dans une région sont im; temps plus sensibles que les résidents régionaux, en diminuant notre facteur de correction des voyageurs sensibles – par exemple, voyageurs im; fois plus sensible et -fold ie, les voyageurs im; fois plus sensible Parce que l’estimation de l’incidence de l’Asie, du Sud dquo; région a été nettement inférieure à ses homologues géographiques, nous avons évalué son impact en utilisant à la fois une multiplication par une multiplication par

Table View largeTélécharger la diapositiveCorrélation entre les paramètres d’entrée et la distribution du nombre annuel de cas de gastroentérite à Salmonella dans le monde, en affichant le tableau des variables en haut View largeTélécharger la diapositiveCorrélation entre les paramètres d’entrée et la distribution du nombre annuel de cas de gastroentérite à Salmonella dans le monde entier Variables

Table View largeTableau de téléchargementFacture mondiale annuelle de la gastroentérite à Salmonella, Circa, sous différents scénariosTable View largeTélécharger diapositiveFacture mondiale annuelle de la gastroentérite à Salmonella, Circa, sous différents scénarios

Discussion

Les travaux futurs devraient envisager d’en tenir compte, par exemple en augmentant l’étalement des distributions d’incertitude en fonction du type d’étude, et en augmentant l’incertitude des résultats pour certaines régions en fonction de la nature de l’extrapolation effectuée. Pour estimer le nombre annuel de décès, le taux de létalité – et, partant, le nombre estimé de décès par an dus à l’infection à Salmonella – peut être plus élevé les pays où la nutrition est mauvaise et l’accès limité aux soins de santé Malheureusement, peu de données publiées existent pour améliorer ces estimations; Le nombre estimé de décès rapportés ici doit être considéré comme une valeur prudente. Nous avons limité cette étude à l’évaluation du fardeau de la gastroentérite causée par Salmonella en termes de nombre de cas et de décès. Nous n’avons pas cherché à estimer son impact en termes d’hospitalisation, d’invalidité , séquelles à long terme ou coûts économiques en raison du manque de données Ces facteurs ont un impact considérable sur le fardeau de la santé humaine et devraient être pris en compte à l’avenir. Nous n’avons pas non plus pris en compte l’infection invasive à Salmonella. régions prédominantes, comme l’Afrique subsaharienneNous avons estimé le nombre de cas d’origine alimentaire en faisant la moyenne des valeurs publiées de la proportion estimée d’infections à Salmonella qui étaient d’origine alimentaire [,,, -], et en appliquant cette moyenne à notre estimation. sous réserve de plusieurs limitations Premièrement, puisque nous avons appliqué une seule proportion au nombre total de cas, nous avons supposé que Cependant, la proportion varie probablement beaucoup d’un pays et d’une région à l’autre. Il est nécessaire de disposer de plus d’informations sur la transmission alimentaire des salmonelles par les pays et les régions, en particulier dans les régions en développement Les informations provenant des pays en développement sont particulièrement nécessaires étant donné que toutes les estimations publiées de la proportion d’infections à Salmonella qui sont d’origine alimentaire proviennent actuellement de pays développés. reconnaître que la proportion d’aliments d’origine alimentaire est probablement inférieure dans les pays en développement parce que la proportion d’eau est probablement plus élevée. En l’absence d’estimations régionales, nous avons extrapolé une moyenne de toutes les estimations publiées de la proportion d’aliments d’origine mondiale. de cette étude, je s la dépendance significative de ses résultats sur l’estimation de l’incidence chinoise non publiée Pour répondre à cela, nous avons exploré l’impact de l’utilisation des données de retour des voyageurs et de l’extrapolation de l’Asie-Pacifique, High Income dquo; Région au lieu des données de la Chine Malheureusement, les deux sources de données alternatives ont leurs propres biais inhérents. Une critique majeure des analyses comme celle-ci est l’utilisation de données provenant principalement des pays développés, donnant des valeurs qui sous-estiment considérablement l’incidence réelle des maladies. Global Salm-Surv, un réseau international d’épidémiologistes et de scientifiques de laboratoire, nous a permis d’identifier une étude non publiée de la Chine qui nous a semblé décrire avec plus de précision l’incidence de l’infection à Salmonella dans cette région peuplée. L’estimation chinoise est significativement plus élevée que les autres études de multiplicateur, bien que cela soit probablement dû à de véritables différences de taux de maladie entre les populations. Elle est également plus élevée que les données sur les voyageurs qui reviennent; et d’autres régions adjacentes, bien que cela soit probablement dû au biais associé aux données de retour des voyageurs comme discuté ci-dessus. Malheureusement, d’autres sources d’information, par exemple, les données de notification de maladie pour valider notre choix d’estimation, n’étaient pas disponibles. ; Nous avons donc choisi les données qui nous ont semblé le plus représentatif de l’incidence dans la régionSalmonella cause un fardeau considérable à l’échelle mondiale Bien que soumises à plusieurs limites, ces données fournissent des informations importantes pour l’établissement de priorités dans des régions spécifiques. Maladies d’origine alimentaire dans certaines régions Il n’y avait pas de données de notification publiquement disponibles dans certaines régions, y compris celles ayant une forte proportion de la population mondiale, telles que l’Asie du Sud / Sud-Est et l’Amérique du Sud. L’évaluation de la charge réelle de l’infection à Salmonella doit être priorisée dans les pays de ces régions, par exemple via des initiatives de renforcement des capacités telles que OMS Global Salm-Surv, pour améliorer les estimations de la charge mondiale et mieux informer la définition des priorités

Groupe de travail sur le fardeau mondial de la salmonellose

Les membres du groupe de travail sur le fardeau mondial de Salmonella sont classés par ordre alphabétique, sans compter les auteurs Donald Campbell, Birgitte De Jong, Henriette De Valk, Danilo Lo Fo Wong, Rob Lake, Ran Lu, Karin Nygard, Wilfred van Pelt, Paul Sockett, Kate Thomas et Hajime Toyofuku

Remerciements

Nous remercions les membres de la Collaboration internationale sur les maladies entériques du fardeau de la maladie; Études pour la discussion des ébauches de manuscrits précoces et des résultats finaux Les auteurs remercient également le Groupe de référence sur l’épidémiologie du fardeau des maladies d’origine alimentaire de l’Organisation mondiale de la santé pour son évaluation critique des méthodes et des résultats.

Innocuité de différents régimes de réintroduction de médicaments antituberculeux après le développement de l’hépatotoxicité induite par le traitement antituberculeux