Poursuivre l’infection au VIH-

d la diversité et les paramètres connus pour potentiellement influencer la transmission du VIH, tels que le sexe, la présence d’infection génitale active ou le mode d’exposition. Cependant, le nombre de participants présentant une diversité% était trop petit pour permettre des analyses statistiques approfondies de ces associations Le tropisme du VIH a été prédit à partir des séquences d’enveloppe V en utilisant de multiples outils bioinformatiques et, dans un sous-groupe de patients, par analyse phénotypique des virus plasmatiques et cellulaires Il y avait une bonne corrélation, bien que non complète. Concordant avec la vue dominante, la plupart des participants hébergeaient des souches R, et seulement un petit pourcentage de virus utilisant CXCR dans une population mixte ont été détectés dans cette cohorte. La plupart des données précédemment publiées sur la diversité virale après transmission proviennent de plus petites cohortes. différents facteurs de risque pour l’acquisition du VIH ou à partir de données issues de cohortes indépendantes La cohorte de Zurich est une Le groupe d’étude primaire d’observation de l’infection au VIH basé sur le centre, caractérisé par une collecte détaillée et prospective d’un ensemble homogène de données cliniques et de laboratoire et un référentiel d’échantillons riche Ceci a permis l’identification d’un nombre relativement important de personnes infection ou infection récente, basée sur l’examen de données cliniques et de laboratoire, ce qui améliore la précision des estimations du stade et du moment de l’infection. Il s’agit d’une exigence cruciale pour comparer des différences relativement faibles de diversité génétique. pour ces personnes est d’importance évidente pour diminuer la possibilité que toute diversification virale substantielle reflète simplement le temps depuis l’infection, ce qui empêcherait des conclusions fermes sur le type de virus transmis Dans cette étude, les meilleures données proviennent des participants avec infection aiguë, pour qui les possibilités de mal calculer le moment de l’infection étaient minimisé, mais non abrogé Les données de la cohorte de Zurich sont largement représentatives des HSH infectés par le sous-type B VIH- Dans l’ensemble, la proportion de participants ayant une diversité élevée était inférieure à celle récemment signalée dans une cohorte similaire. Cependant, certaines réserves restent présentes. Nous ne pouvons, par exemple, avoir une certitude absolue sur la modalité de transmission, car celle-ci est généralement autodéclarée et n’exclut pas nécessairement d’autres facteurs de risque, comme les UDI associés, qui peuvent faciliter la transmission d’une population de virus plus hétérogène Inversement, les comparaisons directes avec les cohortes d’UDI sont compliquées par le fait que la transmission sexuelle reste une possibilité importante dans les cohortes d’UDI, comme le suggère le taux élevé d’infections sexuellement transmissibles . Il existe des limites reconnues à l’évaluation des diversi analyse clonale, y compris les erreurs induites in vitro et, surtout, la représentation incomplète des quasi-espèces si seulement quelques clones sont échantillonnés. Des études supplémentaires sont donc nécessaires en utilisant des techniques telles que le séquençage ultradeeep et d’autres plates-formes de séquençage de nouvelle génération. obtenir une représentation plus sensible des quasi-espèces à ~% avec le séquençage ultradeep Le nombre de clones analysés dans cet article ne permettait pas un tel degré de sensibilité, et en effet, l’échantillonnage des quasi-espèces dominantes était le plus probable avec la méthodologie choisie. un sous-ensemble de participants a également été étudié par séquençage du génome unique avec une bonne reproductibilité des résultats, comparé au clonage, signifie que la probabilité d’erreurs induites in vitro était faible, mais cela n’implique pas que la représentation des quasispécies était plus large. aurait également fait la lumière sur le taux de diversification virale caractéristique des patients, alors que Des études immunologiques couplées à une observation virologique sont nécessaires pour lier le taux de diversification virale à la pression immunologique. Les données fournies dans cet article mettent en évidence l’utilité des cohortes primaires d’infection au VIH pour déterminer le degré de diversification virale à la transmission. Les données soulignent la nécessité de poursuivre les études sur les mécanismes de la transmission du VIH. Parallèlement, une sensibilisation accrue aux symptômes cliniques et l’utilisation d’outils diagnostiques appropriés sont nécessaires pour améliorer le diagnostic de l’infection primaire par le VIH, permettant ainsi le recrutement de grandes cohortes pouvant faire l’objet d’un suivi prospectif. Ce faisant, nous serons en mesure d’élucider les mécanismes de transmission très précoces; surveiller la diversification virale et les facteurs de l’hôte, tels que les réponses immunitaires connues pour favoriser la diversification virale; et traduire ces connaissances en stratégies préventives et thérapeutiques

Remarque

Conflits d’intérêts potentiels

Tous les auteurs: Aucun conflit signalé Tous les auteurs ont soumis le formulaire ICMJE pour la divulgation des conflits d’intérêts potentiels Conflits que les éditeurs considèrent pertinents pour le contenu du manuscrit ont été divulgués